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造血干细胞受其他聚腺苷酸化作用的调节

      造血干细胞(HSC)位于受严格监管的层次结构的顶部 有组织的分化级联。我们的实验室最近执行了多层OMIC 对HSC和多能祖细胞进行分析,以进一步调查监管 维持这种未分化状态的过程(Cabezas-Wallscheid等,细胞 干细胞,2014年; Cabezas-Wallscheid等人,Cell,2017)。这些研究表明 非编码RNA的表达,可变剪接和RNA调控 生物发生对于维持功能性造血系统至关重要。然而 聚腺苷酸化(APA)在成人造血调节中的作用 干/祖细胞区室目前未知。 APA是一种RNA编辑机制 确定三端长度和组成。 3'-非翻译的处理 区域(3-UTR)受到严格调节,并且存在多个聚腺苷酸化信号(PAS) 对于大多数基因。 PAS的选择也决定了RNA的定位和稳定性 作为蛋白质输出。为了阐明APA在体内的作用,我们首先讨论了是否 在稳态下,APA在造血干/祖细胞中受到全球调节 条件和对炎症压力的反应。我们对FACS排序的鼠进行了测序 造血干和祖细胞群,并优化了执行方案 并分析低输入的3-UTR排序。令人惊讶的是,众多基因的差异APA 在稳态和炎症过程中均在HSC和祖细胞中观察到 压力反应。此外,我们进行了基因敲除研究和广泛的体外研究 和体内实验表明,APA调节蛋白对于 HSC的正常功能。总而言之,我们的数据造成了就业差异 APA作为调节HSC控制的造血体系的新层。
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